有目共睹聚丙烯酰胺的溶解度取決于溶解時間，聚丙烯酰胺的溶解度也直接影響其功能。溶解聚丙烯酰胺時，應注意在攪拌加熱條件下，將產品均勻緩慢地加入容器中，避免結塊，在適當的溫度下制備溶液，避免長時間機械剪切過大，否則聚合物會降解，影響使用效果。
聚丙烯酰胺粉末可儲存在干燥涼爽的地方兩年以上，但制成溶液后的儲存時間有限。一般來說，當溶液濃度為0.1%時，非離子和陰離子溶液的儲存時間不得超過一周。陽離子溶液應儲存不超過一天。
聚丙烯酰胺濃度越高，溶液儲存時間越長。但3%至5%的溶液不能直接用于污水處理。使用前必須稀釋。當pH值小于5.5時，陽離子聚丙烯酰胺溶液穩定，當pH值大于6.0時，陽離子聚丙烯酰胺溶液因水解而迅速失效。
與陰離子聚合物相比，聚丙烯酰胺對鐵離子、鈣離子和鎂離子更敏感。鐵離子是導致聚丙烯酰胺化學降解的催化劑。因此，在制備、轉移和儲存聚丙烯酰胺溶液時，應盡量避免鐵離子的存在。溶液接觸設備為不銹鋼、塑料、玻璃纖維增強塑料或碳鋼容器，表面涂有樹脂。這就是聚丙烯酰胺使用后效果不明顯的原因。
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